Zakres
W niniejszej Normie Międzynarodowej podano metodę bezpośredniej ekstrakcji DNA z próbek gleby w celu badania ogólnej struktury i ilości kolonii bakterii glebowych z zastosowaniem technologii opartych na PCR. Niniejsza metoda jest głównie przeznaczona do badania gleb uprawnych i leśnych. Niniejsza metoda może nie być odpowiednia dla gleb o dużej zawartości substancji organicznych (np. gleb torfowych) lub gleb bardzo zanieczyszczonych, zanieczyszczeniami pochodzenia organicznego albo metalami ciężkimi. Bezpośrednia ekstrakcja DNA z próbek gleby umożliwia unikatowe spojrzenie na bogactwo i strukturę kolonii bakterii, które są kluczowymi parametrami do oceny różnorodności biologicznej mikroorganizmów glebowych. Podejście od strony molekularnej, w oparciu o PCR (reakcję łańcuchową polimerazy) - powielanie DNA pochodzącego z gleby - jest obiecują dziedziną wiedzy i może umożliwić, w najbliższej przyszłości, stworzenie procedur, które będą narzędziami do monitorowania mikroorganizmów glebowych w środowisku glebowym. Użytkownicy niniejszej metody powinni zdawać sobie sprawę, że chociaż gleba poddana procedurze ekstrakcji DNA jest dokładnie przesiewana (sito o otworach 2 mm, sposób postępowania opisano w 5,1), to pozostałości pochodzenia roślinnego dalej mogą znajdować się w tych próbkach gleby, w wyniku czego pozostałości DNA pochodzenia mogą zanieczyścić wyekstrahowanie z gleby DNA.
